1873 年,Clay Street 上的纜車開始運行,舊金山的纜車至今仍在城市的坡道上行駛。現代的區域鐵路則從 1972 年 9 月通車的 BART 開始:1974 年,BART 經由海灣底下的 Transbay Tube連接舊金山與奧克蘭,之後路網延伸到舊金山國際機場與南灣的聖荷西一帶,如今共有 50 站。2024 年 9 月,連接舊金山與矽谷的 Caltrain 改用電聯車營運,結束了柴油客運列車的時代。
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